幽門螺桿菌，或幽門螺旋菌（Helicobacter pylori）是一種感染人體胃部的細菌，是一種革蘭氏陰性桿菌，屬於ε-變形菌綱。該菌呈螺旋形，長約2至4微米（1微米為千分之一毫米），端生鞭毛數根，用來協助菌體呈螺旋狀前進。只能寄居於人體胃部，聚集在胃壁的黏液層內，並且靠近胃黏膜層的部分，細菌會分泌鹼性亞摩尼亞（用來保護細菌不被胃酸殺死），也是人類已知的生物中，少數能活在強酸環境之下的。會產生一些會引起發炎反應的酵素，破壞胃黏膜原有的保護機轉，再加上它會誘發胃酸分泌增加，不少胃潰瘍、胃炎等病皆與幽門螺旋桿菌有關，但大多數的帶菌者均不會出現病徵。
1875年，德國的科學家在人體的胃中發現一種螺旋細菌，但無法容器中培植，而研究結果也隨之丟失。
1982年，兩名來自澳大利亞的科學家，華倫和馬歇爾再次發現該種細菌，一種呈S形或弧形彎曲的革蘭陰性桿菌，他們以人體的胃黏液來培植，並得出結論，認為人體的胃潰瘍、胃炎等疾病是因為該種細菌在胃部繁殖，而非人們長久認為的吃辛辣食品、壓力等造成的。1984年英國權威醫學雜誌《柳葉刀》（Lancet）刊載這項報告，全世界掀起了一股研究幽門螺桿菌的熱潮，有關螺桿菌的研究論文不計其數。但仍然有許多醫生不相信這個發現，馬歇爾的導師告訴他：「你的觀點是錯的。」為了證明致病機理，馬歇爾還曾喝下了含有病菌的溶液，結果造成嚴重的胃潰瘍。後來又迅速治療成功。2005年，華倫和馬歇爾因此獲得諾貝爾生理學或醫學獎。
醫學界對該菌與胃部疾病關係的認知較為緩慢，他們一直認為沒有任何細菌能夠長時間在胃部強酸的環境下生存。及後經過更詳細的研究，包括馬歇爾曾喝下試管內的桿菌得到胃炎，並以抗生素治療，醫學界才開始改變對胃病的看法。1994年，美國國立衛生研究院（NIH）提出大多數常見的胃炎疾病均由幽門螺桿菌所造成，在治療過程應加入抗生素。
在正確認識該細菌以前，胃潰瘍病人通常會以中和胃酸及減少分泌的藥物來治療，但經此方法治療後大多會復發。而胃炎患者則會服用鹼式柳酸鉍，這方法通常會見效，當時人們仍不知道其機制，後來才發現藥物中的柳酸鹽會殺死胃部的桿菌，可作為抗生素。現時，這類疾病會以抗生素來殺滅病菌。
幽門螺桿菌是人類至今唯一一種已知的胃部細菌，其他種的螺桿菌也於部分哺乳動物及雀鳥體內找到。
長期的潰瘍，會導致癌症，因此WHO宣佈胃幽門桿菌為微生物型的致癌物質，也是第一個致癌物質。
